12 listopada 2007 roku ambasador Niemiec Michael H. Gerdts oraz przewodniczący Stowarzyszenia Żydowski Instytut Historyczny Marian Turski podpisali umowę dotyczącą dotacji rządu niemieckiego na rzecz budowy Muzeum. Kwota 5 mln euro zasiliła przygotowanie wystawy głównej oraz techniczne wyposażenie budynku Muzeum. Dotacja rządu niemieckiego była pierwszą dotacją rządową z zagranicy.
Rząd niemiecki przekazuje dotację, by wesprzeć ten jedyny w swoim rodzaju projekt Muzeum, które będzie przybliżać tysiącletni wkład Żydów
w historię i kulturę Polski
– Michael H. Gerdts, były ambasador Niemiec w Polsce.